Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6Q795 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6Q795 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6Q795 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6Q795 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q6Q795 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q6Q795 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6Q795 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6Q795 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6Q795 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6Q795 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6Q795 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6Q795 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6Q795 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6Q795 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6Q795 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6Q795 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6Q795 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6Q795 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6Q795 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6Q795 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6Q795 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6Q795 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6Q795 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6Q795 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6Q795 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q6Q795 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6Q795 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6Q795 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6Q795 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6Q795 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6Q795 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6Q795 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q6Q795 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q6Q795 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q6Q795 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6Q795 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q6Q795 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6Q795 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms