Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOA5Q6Q788 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
APOA5Q6Q788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
APOA5Q6Q788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOA5Q6Q788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
APOA5Q6Q788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms