Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAF7Q6Q0C0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAF7Q6Q0C0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRAF7Q6Q0C0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms