Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTR9Q6PD62 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CTR9Q6PD62 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CTR9Q6PD62 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CTR9Q6PD62 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms