Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EMBQ6PCB8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EMBQ6PCB8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EMBQ6PCB8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EMBQ6PCB8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms