Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEK5Q6P3R8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEK5Q6P3R8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEK5Q6P3R8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NEK5Q6P3R8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms