Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFSP1Q6NVU6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UFSP1Q6NVU6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms