Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC9A4Q6AI14 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC9A4Q6AI14 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC9A4Q6AI14 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC9A4Q6AI14 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms