Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EEF1DP3Q658K8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EEF1DP3Q658K8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EEF1DP3Q658K8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EEF1DP3Q658K8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms