Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RNF123Q5XPI4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RNF123Q5XPI4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RNF123Q5XPI4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RNF123Q5XPI4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RNF123Q5XPI4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms