Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
CARMIL1Q5VZK9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC40.3■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CARMIL1Q5VZK9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CARMIL1Q5VZK9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CARMIL1Q5VZK9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CARMIL1Q5VZK9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms