Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRAMEF17Q5VTA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRAMEF17Q5VTA0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF17Q5VTA0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms