Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRC38Q5VT99 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC38Q5VT99 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC38Q5VT99 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC38Q5VT99 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms