Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
RPRD2Q5VT52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
RPRD2Q5VT52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RPRD2Q5VT52 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RPRD2Q5VT52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RPRD2Q5VT52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms