Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRAMEF5Q5TYX0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRAMEF5Q5TYX0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PRAMEF5Q5TYX0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF5Q5TYX0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF5Q5TYX0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF5Q5TYX0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PRAMEF5Q5TYX0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms