Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC181Q5TID7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC181Q5TID7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC181Q5TID7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms