Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC04

ATP1A1-AS1, Putative uncharacterized protein ATP1A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A1-AS1Q5TC04 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1A1-AS1Q5TC04 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP1A1-AS1Q5TC04 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.5 ms