Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCNJQ5T5M9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNJQ5T5M9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNJQ5T5M9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNJQ5T5M9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNJQ5T5M9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNJQ5T5M9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNJQ5T5M9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNJQ5T5M9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
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