Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HECTD3Q5T447 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HECTD3Q5T447 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HECTD3Q5T447 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HECTD3Q5T447 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.1 ms