Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NHSL1Q5SYE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NHSL1Q5SYE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NHSL1Q5SYE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NHSL1Q5SYE7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NHSL1Q5SYE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms