Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPECC1Q5M775 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPECC1Q5M775 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SPECC1Q5M775 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPECC1Q5M775 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms