Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EMC4Q5J8M3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EMC4Q5J8M3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC4Q5J8M3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC4Q5J8M3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms