Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRDTQ58F21 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
BRDTQ58F21 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BRDTQ58F21 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRDTQ58F21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRDTQ58F21 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRDTQ58F21 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRDTQ58F21 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRDTQ58F21 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRDTQ58F21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRDTQ58F21 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRDTQ58F21 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRDTQ58F21 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRDTQ58F21 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
BRDTQ58F21 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRDTQ58F21 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRDTQ58F21 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRDTQ58F21 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRDTQ58F21 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRDTQ58F21 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
BRDTQ58F21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
BRDTQ58F21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRDTQ58F21 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRDTQ58F21 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRDTQ58F21 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRDTQ58F21 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms