Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LACTB2Q53H82 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LACTB2Q53H82 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LACTB2Q53H82 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms