Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZNF394Q53GI3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZNF394Q53GI3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF394Q53GI3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms