Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMG9

TMEM52B, Transmembrane protein 52B, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52BQ4KMG9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM52BQ4KMG9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM52BQ4KMG9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM52BQ4KMG9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM52BQ4KMG9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM52BQ4KMG9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM52BQ4KMG9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms