Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CERKLQ49MI3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CERKLQ49MI3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CERKLQ49MI3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CERKLQ49MI3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms