Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LONRF3Q496Y0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LONRF3Q496Y0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LONRF3Q496Y0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms