Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNF212Q495C1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNF212Q495C1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RNF212Q495C1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms