Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CFAP100Q494V2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP100Q494V2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP100Q494V2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms