Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KRTAP21-2Q3LI59 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms