Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNPY1Q3B7I2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNPY1Q3B7I2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNPY1Q3B7I2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNPY1Q3B7I2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
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