Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TWISTNBQ3B726 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TWISTNBQ3B726 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TWISTNBQ3B726 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
TWISTNBQ3B726 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TWISTNBQ3B726 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TWISTNBQ3B726 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms