Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RFX7Q2KHR2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RFX7Q2KHR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RFX7Q2KHR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RFX7Q2KHR2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms