Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA9Q16795 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDUFA9Q16795 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDUFA9Q16795 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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