Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST3H3Q16695 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST3H3Q16695 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HIST3H3Q16695 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms