Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SGCAQ16586 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SGCAQ16586 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SGCAQ16586 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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