Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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KCNMB1Q16558 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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KCNMB1Q16558 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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KCNMB1Q16558 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMB1Q16558 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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KCNMB1Q16558 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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KCNMB1Q16558 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNMB1Q16558 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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