Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDC37Q16543 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDC37Q16543 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC37Q16543 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
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