Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHRNA2Q15822 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CHRNA2Q15822 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CHRNA2Q15822 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHRNA2Q15822 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CHRNA2Q15822 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms