Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIP4Q15650 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIP4Q15650 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIP4Q15650 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms