Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF4Q15306 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRF4Q15306 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRF4Q15306 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRF4Q15306 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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