Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPNMBQ14956 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPNMBQ14956 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPNMBQ14956 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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