Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
RBM39Q14498 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RBM39Q14498 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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