Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ALCAMQ13740 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ALCAMQ13740 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALCAMQ13740 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALCAMQ13740 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
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