Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NEUROD1Q13562 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NEUROD1Q13562 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
NEUROD1Q13562 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NEUROD1Q13562 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NEUROD1Q13562 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
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