Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAMK2BQ13554 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMK2BQ13554 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMK2BQ13554 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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