Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RIPK1Q13546 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIPK1Q13546 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIPK1Q13546 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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