Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSAMPQ13449 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LSAMPQ13449 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LSAMPQ13449 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms