Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
XRCC4Q13426 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XRCC4Q13426 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
XRCC4Q13426 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
XRCC4Q13426 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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